DogaはL1以外はアニメで出力する機能が有料ですし、ボーンが使えないという致命的な弱点が……。ロボットなどはいいのですが、人体を綺麗に作るのは難しいです。
MMDはモデリングを排除してモーションに特化したのが良かったのだと思います。モデリングの敷居は高いですから。

＞Vocaloid1
Blogでの扱いには詳しくないですが、ニコニコでは大活躍してますよ。まあ、これは機能面ではなく声質やキャラクターとしての使い易さからですけど。