補足です。
>> 要するに、仮名漢字で指定されたアンカーやファイル名に飛べないものだと思ってかかれということ
「文字コード」が異なる場合、仮名漢字で指定されたアンカーやファイル名に飛べないと思ってかかれ です。

IEだと仮名漢字で指定されたアンカーに大抵飛べるのは
1.ページ読み込み
2.文字コードを認識し、内部的におそらくUTF-8へ変換
3.アンカーへジャンプ
という手順をとっているからだと思われます。
そして、Mozillaなどが文字コードが一致していない場合に指定したアンカーへ飛べないことがあるのは、おそらくW3C勧告で推奨されている手順をそのまま使っているため、同じ文字であっても文字コードが異なればURIエスケープした結果が違うものになってしまうことによるものでしょう。