自分もＦＤが無くなると困る人です。
ＯＳのセットアップにＦＤ起動を愛用してます、ＷＩＮ９５からＷＩＮＸＰに至る現在まで。
普通に真ッ更なＨＤＤにインスコするならＣＤＲＯＭ起動で問題ないのですが、
使ってるウチにＰＣが不調になかけて、既に壊れかけたＯＳの入ってるＨＤＤに再インストする場合、

ＣＤＲＯＭから起動　→　フォーマット＆パーテイション切り分け　→　ＯＳインストール

が使えない。いくらＢＩＯＳ設定を変えてみても、ＣＤＲＯＭ起動する前に壊れかけたＯＳが起動しちゃうから。
ＦＤ起動なら、そんな事はないのですが。
まー、壊れかけたＯＳの入ってるＨＤＤを他のＰＣに仮つなぎしてフォーマットすればイイのだけど、面倒だから。
きっとレコード針のように無くなりはしないだろうけど、いつまで長生きしてくれＦＤＤ。

後ね、前にも書いたけど、ＵＳＢ接続ならＸＰでも読み書き出来るし、２０００ならフォーマットも可能。
そこまで投資する事でもないだろうけど、一応報告。

USB-FDX4
http://www.iodata.jp/prod/storage/fd/2005/usb-fdx4/index.htm

FD-2USB
http://buffalo.jp/products/catalog/item/f/fd-2usb/index.html